Identifikasi Ragam Protein Faktor Transkripsi Gen β-AS Arabidopsis thaliana dalam Biosintesis Saponin

SANTOSO, AGUS MUJI Identifikasi Ragam Protein Faktor Transkripsi Gen β-AS Arabidopsis thaliana dalam Biosintesis Saponin. Seminar Naisonal Biologi II “Inovasi Penelitian dan Pembelajaran dalam Mewujudukan Sumber Daya Manusia Berkualitas Menuju Abad ke 21, 2 (1). pp. 62-65. ISSN ISBN 978 – 602 – 0951 – 11 – 9

	Text 84205_0713088605.pdf Download (2MB)
	Text 84205_0713088605_peer review.pdf Download (561kB)
	Text 84205_0713088605_similarity.pdf Download (1MB)
	Text 84205_0713088605_ref.pdf Download (485kB)

Abstract

Rekayasa hayati jalur biosintesis saponin tanaman memerlukan data transkriptomik yang lengkap, termasuk data faktor transkripsi. Biosintesis saponin melibatkan enzim kunci βamyrin synthase yang dikendalikan oleh sekuen gen β-AS dan beberapa protein faktor transkripsi yang belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengungkap jenis faktor transkripsi gen β-AS A. thaliana. Penelitian ini diawali dengan menganalisis sekuen whole genom A. tahliana menggunakan program BLASS untuk menentukan arah transkripsi gen βAS. Sekuen yang berada di depan stat codon tersebut dianalisis secara in silico sehingga diketahui dua flank promotor. Kemudian sekuen target dianalisis dengan tfbind untuk menentukan jenis protein faktor transkripsi (dengan nilai batas similarity > 0,9). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat 30 faktor transkripsi pada sekuen promotor flank pertama dan faktor transkripsi GATA, SRY, GATA1, EVI1, GATA3 memiliki potensi berinteraksi yang lebih tinggi dengan sekuen β-AS. Adapun sekuen promotor flank kedua diperoleh 28 faktor transkripsi dan LFY1, GATA3, GATA1, GATA2,GATA berpotensi berinteraksi dengan sekuen target. Sejumlah 58 jenis protein faktor transkripsi tersebut tidak memiliki motif EF-band yang mampu berikatan dengan Ca maupun berinteraksi dengan CaM. 2+

Actions (login required)

View Item