Metode untuk Menentukan Jenis Faktor Transkripsi (FT) pada Gen Penyandi Enzim β-Amyrin Synthase Berbasis Kajian In Silico: Studi Kasus pada Tanaman Model

SANTOSO, AGUS MUJI Metode untuk Menentukan Jenis Faktor Transkripsi (FT) pada Gen Penyandi Enzim β-Amyrin Synthase Berbasis Kajian In Silico: Studi Kasus pada Tanaman Model. Seminar Nasional II (Biologi, Pembelajaran, dan Lingkungan Hidup Perspektif Interdisipliner), 2 (1). pp. 1098-1104. ISSN ISBN : 979-979-796-179-4

	Text 84205_0713088605.pdf Download (5MB)
	Text 84205_0713088605_peer review.pdf Download (540kB)
	Text 84205_0713088605_ref.pdf Download (5MB)
	Text 84205_0713088605_similarity.pdf Download (1MB)

Abstract

Saponin termasuk senyawa obat yang dikendalikan produksinya oleh beberapa gen kunci, termasuk gen β-AS. Salah satu tahapan penting yang dapat dilakukan dalam rekayasa hayati untuk memacu produksi saponin tanaman adalah menentukan jenis FT pada gen kunci. Metode in vitro dan in vivo tidak dapat digunakan secara langsung untuk menentukan jenis FT yang mengendalikan gen target karena tidak efisien dan efektif. Oleh karena itu, penentuan awal jenis FT berbasis kajian in silico perlu dilakukan. Makalah ini bertujuan mendeskripsikan beberapa tahapan yang dapat dilakukan untuk menentukan jenis FT gen β-AS. Penelitian ini berjenis studi kasus hasil eksploasi data base tanaman model A. thaliana. Penelitian ini mengungkapkan ada 4 tahapan utama yaitu menentukan sekuen gen β-AS dan arah transkripsinya, menentukan sekuen promotor dari sekuen CDS, menelusur jenis FT dengan program tfbind dan menentukan FT dengan nilai interaksi tertinggi, memetakan FT terpilih dengan data base pada PlantFTDB. Jenis FT yang diperoleh dapat digunakan sebagai dasar untuk menentukan metode dan teknik laboratorium untuk kepentingan selanjutnya.

Actions (login required)

View Item